Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms