Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lamp1P11438 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms