Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms