Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf1P09925 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf1P09925 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf1P09925 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Surf1P09925 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf1P09925 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf1P09925 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf1P09925 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf1P09925 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf1P09925 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms