Protein–RNA interactions for Protein: P04187

Gzmb, Granzyme B(G,H), mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmbP04187 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GzmbP04187 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GzmbP04187 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GzmbP04187 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GzmbP04187 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GzmbP04187 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GzmbP04187 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
GzmbP04187 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GzmbP04187 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GzmbP04187 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
GzmbP04187 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GzmbP04187 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GzmbP04187 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms