Protein–RNA interactions for Protein: P01736

T-cell receptor beta chain V region PHDS203 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01736 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01736 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01736 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01736 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
P01736 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01736 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01736 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P01736 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
P01736 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01736 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01736 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01736 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01736 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01736 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01736 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01736 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01736 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01736 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01736 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01736 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01736 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01736 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01736 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01736 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01736 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01736 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01736 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01736 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01736 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01736 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01736 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01736 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01736 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01736 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01736 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01736 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01736 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01736 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P01736 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01736 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01736 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01736 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01736 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01736 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01736 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01736 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01736 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01736 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01736 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01736 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01736 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01736 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01736 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01736 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01736 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01736 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01736 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01736 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01736 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P01736 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P01736 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P01736 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P01736 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P01736 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P01736 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P01736 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P01736 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P01736 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P01736 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P01736 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P01736 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P01736 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
P01736 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P01736 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
P01736 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P01736 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P01736 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
P01736 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P01736 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
P01736 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
P01736 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P01736 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P01736 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P01736 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P01736 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P01736 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P01736 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
P01736 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P01736 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P01736 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P01736 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
P01736 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
P01736 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
P01736 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P01736 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P01736 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P01736 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P01736 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
P01736 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
P01736 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms