Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Col5a1O88207 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Col5a1O88207 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Col5a1O88207 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Col5a1O88207 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Col5a1O88207 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Col5a1O88207 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Col5a1O88207 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Col5a1O88207 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Col5a1O88207 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Col5a1O88207 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Col5a1O88207 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Col5a1O88207 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Col5a1O88207 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Col5a1O88207 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Col5a1O88207 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a1O88207 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a1O88207 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a1O88207 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a1O88207 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a1O88207 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a1O88207 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a1O88207 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a1O88207 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a1O88207 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a1O88207 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a1O88207 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a1O88207 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a1O88207 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a1O88207 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a1O88207 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a1O88207 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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