Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16O54909 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms