Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timm44O35857 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timm44O35857 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timm44O35857 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Timm44O35857 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Timm44O35857 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Timm44O35857 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Timm44O35857 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Timm44O35857 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Timm44O35857 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Timm44O35857 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Timm44O35857 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Timm44O35857 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Timm44O35857 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Timm44O35857 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Timm44O35857 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Timm44O35857 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Timm44O35857 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Timm44O35857 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Timm44O35857 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Timm44O35857 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Timm44O35857 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Timm44O35857 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Timm44O35857 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Timm44O35857 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Timm44O35857 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Timm44O35857 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Timm44O35857 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Timm44O35857 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Timm44O35857 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Timm44O35857 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.7 ms