Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk2O35491 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk2O35491 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk2O35491 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk2O35491 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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