Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ptpn9O35239 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ptpn9O35239 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ptpn9O35239 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ptpn9O35239 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ptpn9O35239 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ptpn9O35239 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms