Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C4

Gm4340, Predicted gene 4340, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4340L7N2C4 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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Gm4340L7N2C4 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm4340L7N2C4 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm4340L7N2C4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm4340L7N2C4 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm4340L7N2C4 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm4340L7N2C4 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm4340L7N2C4 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm4340L7N2C4 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm4340L7N2C4 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms