Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms