Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms