Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms