Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm21976J3QNN2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Gm21976J3QNN2 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
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Gm21976J3QNN2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Gm21976J3QNN2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms