Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms