Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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