Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms