Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Srp72F8VQC1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms