Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms