Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Trim42-201ENSMUST00000035026 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Med12-204ENSMUST00000117706 6940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Ralgapa1-212ENSMUST00000226244 8841 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Edar-201ENSMUST00000003312 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Olfr999-ps1-201ENSMUST00000122319 949 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Mon2-203ENSMUST00000170935 5302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Atp1a3-202ENSMUST00000102858 3895 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Coro7-201ENSMUST00000038552 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Tcf24-201ENSMUST00000097824 2639 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Tomm40l-203ENSMUST00000111327 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Nrxn3-205ENSMUST00000163134 7922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Cenpi-201ENSMUST00000081064 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Firre-206ENSMUST00000203933 5555 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 2900027M19Rik-201ENSMUST00000207411 4448 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Hpgds-201ENSMUST00000031982 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Kalrn-212ENSMUST00000114973 5253 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Ctc1-211ENSMUST00000161455 3989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Osmr-204ENSMUST00000176826 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Hyal1-201ENSMUST00000010195 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 4930455D15Rik-201ENSMUST00000181632 1616 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Dhdh-201ENSMUST00000011526 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Ncam1-202ENSMUST00000166811 3088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gm42741-201ENSMUST00000201340 2278 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Sall4-203ENSMUST00000103074 3741 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Ctc1-201ENSMUST00000021278 4164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Naca-202ENSMUST00000092048 6745 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gm38169-201ENSMUST00000191822 2539 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 A430072C10Rik-201ENSMUST00000197848 2532 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Crcp-206ENSMUST00000202756 600 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms