Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9D8

Ankrd35, Ankyrin repeat domain 35, mousemouse

Predictions only

Length 996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd35E9Q9D8 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd35E9Q9D8 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ankrd35E9Q9D8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ankrd35E9Q9D8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd35E9Q9D8 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd35E9Q9D8 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd35E9Q9D8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd35E9Q9D8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd35E9Q9D8 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd35E9Q9D8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd35E9Q9D8 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd35E9Q9D8 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd35E9Q9D8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd35E9Q9D8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd35E9Q9D8 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd35E9Q9D8 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd35E9Q9D8 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd35E9Q9D8 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd35E9Q9D8 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd35E9Q9D8 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd35E9Q9D8 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd35E9Q9D8 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd35E9Q9D8 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd35E9Q9D8 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd35E9Q9D8 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd35E9Q9D8 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd35E9Q9D8 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd35E9Q9D8 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms