Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms