Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms