Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm3298E9PW80 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms