Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms