Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6R0

Gm5478, Predicted pseudogene 5478, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5478D3Z6R0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5478D3Z6R0 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5478D3Z6R0 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5478D3Z6R0 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5478D3Z6R0 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5478D3Z6R0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5478D3Z6R0 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5478D3Z6R0 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5478D3Z6R0 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5478D3Z6R0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5478D3Z6R0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5478D3Z6R0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5478D3Z6R0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5478D3Z6R0 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5478D3Z6R0 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5478D3Z6R0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5478D3Z6R0 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5478D3Z6R0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5478D3Z6R0 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5478D3Z6R0 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5478D3Z6R0 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5478D3Z6R0 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5478D3Z6R0 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5478D3Z6R0 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5478D3Z6R0 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5478D3Z6R0 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5478D3Z6R0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms