Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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