Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms