Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms