Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Grik3B1AS29 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Grik3B1AS29 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Grik3B1AS29 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Grik3B1AS29 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Grik3B1AS29 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Grik3B1AS29 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Grik3B1AS29 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Grik3B1AS29 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Grik3B1AS29 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Grik3B1AS29 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Grik3B1AS29 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Grik3B1AS29 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Grik3B1AS29 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Grik3B1AS29 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Grik3B1AS29 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Grik3B1AS29 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Grik3B1AS29 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Grik3B1AS29 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Grik3B1AS29 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Grik3B1AS29 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Grik3B1AS29 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Grik3B1AS29 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Grik3B1AS29 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Grik3B1AS29 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Grik3B1AS29 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Grik3B1AS29 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Grik3B1AS29 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Grik3B1AS29 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Grik3B1AS29 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Grik3B1AS29 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
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