Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms