Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms