Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms