Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrit3W8DXL4 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms