Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Gm5538W4VSP6 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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Gm5538W4VSP6 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Gm5538W4VSP6 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Gm5538W4VSP6 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Gm5538W4VSP6 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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