Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms