Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn7Q9Z261 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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