Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W4

Gdf11, Growth/differentiation factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf11Q9Z1W4 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf11Q9Z1W4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms