Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme3Q9WV85 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme3Q9WV85 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme3Q9WV85 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme3Q9WV85 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme3Q9WV85 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme3Q9WV85 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme3Q9WV85 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme3Q9WV85 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme3Q9WV85 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme3Q9WV85 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme3Q9WV85 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme3Q9WV85 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme3Q9WV85 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme3Q9WV85 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme3Q9WV85 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme3Q9WV85 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme3Q9WV85 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme3Q9WV85 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme3Q9WV85 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme3Q9WV85 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme3Q9WV85 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme3Q9WV85 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme3Q9WV85 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme3Q9WV85 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme3Q9WV85 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme3Q9WV85 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme3Q9WV85 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme3Q9WV85 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme3Q9WV85 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme3Q9WV85 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme3Q9WV85 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme3Q9WV85 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme3Q9WV85 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme3Q9WV85 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme3Q9WV85 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nme3Q9WV85 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nme3Q9WV85 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nme3Q9WV85 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nme3Q9WV85 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nme3Q9WV85 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nme3Q9WV85 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nme3Q9WV85 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nme3Q9WV85 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nme3Q9WV85 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nme3Q9WV85 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nme3Q9WV85 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms