Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms