Protein–RNA interactions for Protein: Q9R112

Sqor, Sulfide:quinone oxidoreductase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SqorQ9R112 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SqorQ9R112 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms