Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CtsjQ9R014 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms