Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Gm45166-201ENSMUST00000209073 683 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrfQ9JM73 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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