Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms