Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trem1Q9JKE2 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms