Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ap3m1Q9JKC8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms