Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1fQ9JIS7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1fQ9JIS7 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1fQ9JIS7 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1fQ9JIS7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1fQ9JIS7 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1fQ9JIS7 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1fQ9JIS7 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1fQ9JIS7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1fQ9JIS7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1fQ9JIS7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1fQ9JIS7 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1fQ9JIS7 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1fQ9JIS7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacna1fQ9JIS7 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacna1fQ9JIS7 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms