Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
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Trim39Q9ESN2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Trim39Q9ESN2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Trim39Q9ESN2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Trim39Q9ESN2 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
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Trim39Q9ESN2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim39Q9ESN2 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim39Q9ESN2 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim39Q9ESN2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Trim39Q9ESN2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Trim39Q9ESN2 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim39Q9ESN2 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim39Q9ESN2 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Trim39Q9ESN2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Trim39Q9ESN2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Trim39Q9ESN2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim39Q9ESN2 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Trim39Q9ESN2 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Trim39Q9ESN2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim39Q9ESN2 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim39Q9ESN2 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim39Q9ESN2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim39Q9ESN2 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim39Q9ESN2 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim39Q9ESN2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim39Q9ESN2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim39Q9ESN2 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim39Q9ESN2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim39Q9ESN2 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim39Q9ESN2 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim39Q9ESN2 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim39Q9ESN2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim39Q9ESN2 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim39Q9ESN2 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim39Q9ESN2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim39Q9ESN2 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim39Q9ESN2 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim39Q9ESN2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim39Q9ESN2 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim39Q9ESN2 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim39Q9ESN2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim39Q9ESN2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim39Q9ESN2 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim39Q9ESN2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim39Q9ESN2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms